Фауна республики Хакасия полностью отражает животных и природу заповедника.
Из мелких млекопитающих распространены такие животные, как джунгарский хомяк, заяц-русак, лисица, полевка, длиннохвостый суслик и джунгарский хомяк.
К крупным – волк, косуля, бурый медведь, рысь, росомаха, саянский северный олень, лось, кабарга, марал.
Марал, это красивый благородный и наиболее крупный подвид оленя, который обитает в нашей стране. Питается марал раной растительностью. Территорию занимают по размерам, зависящую от того, насколько на ней много корма. Живут в горах стадами, ведут кочевой образ жизни. Волки, тигры, рычи, леопарды, медведи и росомахи являются природными врагами маралом. Но, с полным правом можно считать главным врагом благородного оленя, человека.
Волки предпочитают степи, тундры, полупустыни, лесостепи, избегают лесных густых массивов. Живут на определенных участках, ведут оседлый образ жизни. Свое логово устраивают в расщелинах скал, зарослях или кустарниках. Питается оленями, косулями, лосями, дикими кабанами. Ловят рыбу, зайцев, лисиц, енотовидных собак, корсаков. На охоту выходят ночью. Громким воем они дают знать о своем появлении. Природа одарила волков отличным слухом, что не скажешь про зрение и обоняние. Это животное ловкое, сильное и быстрое, и все это благодаря хорошо развитой высшей нервной деятельности.
Заяц-русак степное животное, которое обитает на открытых пространствах, степных и лесостепных ландшафтах. Редко встречаются в глубине хвойных массивов. Активны зайцы-русаки в сумеречное и ночное время суток. Бегают быстро и прыгают на длинные расстояния. Питаются молодыми побегами кустарников и деревьев, растениями, листьями, корнями.
Еще на территории республики Хакасии обитает выдра, американская норка, заяц-беляк, олень и другие.
