Одной из актуальных проблем, вставших перед Мордовским заповедником сразу после его организации, да и по сей день, является проблема «волк-копытные». Волка считали то основным врагом копытных, в частности, в условиях нашего заповедника врагом пятнистого оленя, то естественным регулятором его численности, способствующим оздоровлению популяции.
До сих пор нет единого варианта решения этой проблемы. Некоторые специалисты считают правильным вариант всеобщего сокращения поголовья волка, т. е. истреблять его повсеместно. Другие стоят на позициях сохранения его в малонарушенных экосистемах и крупных по площади заповедниках. Ряд авторов высказывают опасение, что сохранение волка в малых по площади заповедниках может представлять серьезную угрозу животноводству на сопредельных территориях.
Разнообразие взглядов на эту проблему, по-видимому, вытекает из недостаточности знаний экологии волка, его места и роли в биоценозах. Каких-либо с печальных исследований по волку в Мордовском заповеднике за время его существования не проводилось.
Начиная с 1937 г. во многих заповедниках, в том числе и в Мордовском, было начато плановое истребление волка, которое продолжалось до середины 60-х волка в Мордовии в сороковые годы ежегодно добывалось до 500 зверей; в пятидесятые наблюдалось резкое снижение его численности и, соответственно, его добычи (до 70 особей за год). В шестидесятые годы волк в заготовках пушнины отсутствует. Та же картина наблюдается и в заповеднике. В сороковые годы добыто 80 зверей, в пятидесятые — 46, а за 1960-1965 гг. — всего 17 экземпляров. В последующие годы заходы волка в заповедник стали единичными и нерегулярными.
Интенсивная борьба с хищником, продолжавшаяся до середины 60-х гг., породила следующую проблему. К этому времени значительно возросла в заповеднике (до 29 особей на 1 000 га) суммарная численность копытных, особенно пятнистого оленя, появились предпосылки перенаселения и, как следствие, деградация зимних кормовых станций.
Таким образом, перед заповедником встала новая задача — регулирование численности пятнистого оленя путем его отстрела — которую он начинает решать с 1967 года.